藥丸干燥設備的工作原理是在微波能加熱的作用下，浸膏自身快速生熱，水份蒸發達到干燥的目的，這種干燥方式不需要通過介質傳導，微波能量直接作用在浸膏上，干燥過程不會出現表面硬化、排水困難的問題，同時在物品的干燥過程中，水分的蒸發溫度與大氣壓有直接的關系，大氣壓力越低，水的沸點越低，在一個大氣壓下水的沸點是100°C，當真空度小于 -0.9 兆帕斯卡時，水的蒸發溫度為 30～40℃。
　　物料在采用藥丸干燥設備處理時，需要補升華熱。在真空條件下，水的汽化溫度低，實現了低溫干燥，完好的保持了加工物料原有的色、香、味及營養成分，避免了物料中活性成分的氧化變質，制品復水性好；微波穿透至物料內部，回轉系統驅動物料做回轉運動，使物料受熱更均勻，干燥更迅速，其運行成本遠遠低于冷凍干燥和紅外干燥，節能降耗、衛生環保；充分利用微波的加熱均勻物料內外溫差小，既利用了真空干燥的特點，又解決了真空中熱能傳導困難的問題，大大提高了干燥的工作效率和產品質量。根據國內外資料顯示，采用微波設備對物料加熱，其速度和效能是常規加熱方法的4~20倍。
　　因此，物體處于真空狀態條件下，其中的水分可在較低溫度下蒸發，使物品在低溫下干燥。 浸膏微波干燥溫度低，能zui大限度保持藥效，因此它具有干燥質量高、干燥速度快、生產成本低、節約能源、收得率高、操作簡單等特點，完全達到浸膏干燥的要求。
　　藥丸干燥設備應用中應注意的安全問題：
　　1.藥丸干燥設備應用中物料中不能包含金屬鐵屑，微波不但不能為金屬加熱而有反射的作用，微波在金屬中激發電子產生大電流而在金屬鐵屑和爐體之間產生大電流放電火花，嚴重會導致火災。
　　2.藥丸干燥設備爐門如發現有凸凹現象請停止使用，凸凹關閉不嚴的爐門會引起微波泄漏。
　　3.藥丸干燥設備中不能放入密封性的物品（如帶殼的雞蛋），微波穿透內部加熱，速度極快，會引起爆炸。
　　4.應定期清潔藥丸干燥設備衛生，及時清理生產過程中掉下物料，以免再次生產時間過長后溫度過高而產生著火。